近日,《科學》雜志刊登了瑞典科學家的重要成果——全球首份癌癥病例圖譜“Atlas”,該圖譜將數千種特定癌癥相關基因與患者生存情況聯系起來,發掘出32種不以癌癥類型分類、但與80%人類癌癥相關的“公共”基因,可作為潛在新藥研發的精準靶點。
同時,這一成果將有助于醫生對未來癌癥治療的預測:通過現有的數據,基因組范圍內的個人代謝模型得以建立,研究人員可以借此預測腫瘤的發展,并提出有針對性的治療方案,改善患者預后,延長患者的生存時間。因此,該圖譜被認為是腫瘤臨床實踐革命性改進的重要推手,據悉,Atlas圖譜數據免費向公眾開放(www.proteinatlas.org/pathology ),共享將為其他研究者提供更多參考數據。
另悉,Atlas項目的領導者是來自瑞典皇家理工學院教授馬瑟爾斯·阿合雷,同時任職歐洲生物技術聯合會主席,其帶領科研團隊使用超級計算機,分析了8000種腫瘤樣本中的17種主要類型的人類癌癥,并使用RNA測序方法,了解基因在受癌癥影響時發生的變化,積極尋求”基因突變導致的基因組整體變化。
研究人員確定了2000多個抑制腫瘤生長的基因,但絕大多數基因靶向藥物會同步產生強烈的副作用。經篩選,發現其中32種基因存在于超過80%的腫瘤樣本中,且與癌癥具體類型無關,它們可以作為新藥研發的靶子。
此外,依據腫瘤類型和腫瘤位置,研究人員還發現,超過2000種基因對病人生存率等“預后”有著不同的影響,他們還進一步將這些“預后”基因分為“有利于預后”和“不利于預后”兩類,而以往對”預后“基因的研究屈指可數。
馬瑟爾斯·阿合雷表示:試驗結果表明,大部分癌癥蛋白質編碼基因的表達是有差異的,并且在許多情況下,對患者的存活率產生了很大影響,據系統生物學分析顯示,特定癌癥中個體腫瘤的基因表達差異很大,可能超過不同癌癥類型之間觀察到的變化,然而臨床結局所需的一般預后基因不適用于所有癌癥,而Atlas圖譜中的數據使我們能夠為癌癥患者生成個性化的基因組代謝模型,以確定參與腫瘤生長的關鍵基因。此外,我們還探索了與腫瘤細胞去分化相關的組織特異性基因,以及特定癌癥抗原在全基因組范圍內的作用。
大部分學者對Atlas圖譜都做出了較高的評價,認為該圖譜可以推動臨床精準醫療,特別是其中基因部分的知識,對于特效藥物和廣譜藥物的研發都至關重要;另外,該圖譜還可以讓醫生嘗試性針對病人的臨床數據,做出用藥或手術的精準干預方案,而關于生存期的知識則可以讓醫生對不同患者給出個體化生活方式的指導。
然而,個別學者對圖譜持審慎態度,認為該圖譜并不能給醫生一個明確的答案。
來源:醫谷